تهیه نقشه راه زیست‌فناوری در سه مرحله مطالعه و شناخت وضع موجود زیست فناوری کشاورزی در ایران و جهان، تهیه نقشه راه فنـاورانه محصـولات و در زیست فناوری کشـاورزی و تهیه برنامه ملی توسعه فناوری‌ها و محصولات زیستی در حوزه کشاورزی انجام می‌شود.
بر اساس دیدگاه‌های کارشناسان کارگروه‌های کشاورزی ستاد توسعه زیست فناوری معاونت علمی و فناوری ریاست جمهوری، اولویت تولید محصولات زیست‌فناوری در این طرح در حوزه‌های تراریخته، کشت بافت، زیست مهارگرها، کود زیستی، واکسن‌ها، افزودنی‌های خوراک دام و طیور و کیت تشخیص تعیین شد.
بر همین اساس اولویت تولید محصولات تراریخت شامل پنبه، کلزا، ذرت، چغندرقند، برنج، سویا، یونجه، نیشکر، حبوبات، سیب‌زمینی، پیاز، سورگوم، پایه‌داران، پایه هسته‌داران، پایه مرکبات، گردو، پسته، سیب‌زمینی، پایه‌های دانه‌دار، خرما، پایه‌های هسته‌دار و گیاهان زینتی می‌شود.